ד"ר פפרקורן סיים בהצטיינות את לימודיו בפקולטה לרפואה של הטכניון בחיפה וסיים בהצטיינות את התמחותו ברפואת נשים ובמיילדות במרכז הרפואי "כרמל" בחיפה.
בהמשך השלים התמחות על בתחום האנדוקרינולוגיה של הרבייה ואי פריון במרכז הרפואי של הפקולטה לרפואה באוניברסיטת McGill במונטריאול, קנדה.
טרם נסיעתו לקנדה כיהן ד"ר פפרקורן כאחראי מיון נשים במרכז הרפואי "כרמל", ואף שימש שם כאחראי מתמחים במחלקת נשים. בתחום ההוראה קיבל ד"ר פפרקורן תעודות הצטיינות מטעם הפקולטה לרפואה של הטכניון, שם הדריך ולימד סטודנטים בתחום רפואת הנשים. ד"ר פפרקורן הרצה גם במקומות אחרים, ובכלל זה החוג למדעי הרפואה באוניברסיטת חיפה.
כיום ד״ר פפרקורן עובד ביחידת הפוריות בבית החולים איכילוב.